Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp.

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Número del certificado	15A951401A0
Fecha del certificado	2017-03-03
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Contacto del recurso

Nombre	Valeska Villegas-Escobar
Posición	Profesor titular
Organización	Universidad EAFIT
Dirección	Carrera 49 No 7 Sur 50, Medellín, Antioquia
Contacto	vvilleg2@eafit.edu.co Tel: 4 2619500

Contacto del permiso

Nombre	Felix Londoño
Posición	Dirección de Investigación
Organización	Universidad EAFIT
Dirección	Carrera 49 No 7 Sur 50, Medellin, Antioquia
Contacto	flondono@eafit.edu.co Tel: 4 2619500

Proveedor de los metadatos

Nombre	Valeska Villegas-Escobar
Posición	Profesor Titular
Organización	Universidad EAFIT
Dirección	Carrera 49 No 7 Sur 50, Medellín, Antioquia
Contacto	vvilleg2@eafit.edu.co Tel: 4 2619500

Información del Permiso

Autoridad ambiental	Autoridad Nacional de Licencias Ambientales
Número del permiso	Resolución 1566
Titular del permiso	Universidad EAFIT
Nit o cédula	890901389-5
Fecha de emisión	2014-12-24

Cobertura Geográfica

Descripción	Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). Misión: Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción. El objetivo de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT es conservar en condiciones óptimas las cepas microbianas aisladas del territorio nacional con el fin de acceder a su información molecular y bioquímica con fines científicos no comerciales. Adicionalmente se tiene por objetivo fortalecer el Inventario Nacional de la Biodiversidad y difundir el conocimiento científico acerca de la riqueza de microorganismos y su potencial e importancia en los ecosistemas colombianos. El énfasis de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT está inicialmente enfocado a la conservación de bacterias, hongos y levaduras con el fin de investigar su potencial en diferentes áreas de la industria: agrícola, alimentos y química. Visión: En concordancia con la visión de la Universidad EAFIT, la colección de microorganismos tiene como visión contribuir al progreso de la Nación mediante la conservación y el acceso de la colección. Específicamente se proyecta ampliar la colección de microorganismos para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la biodiversidad nativa colombiana y su potencial en diferentes ámbitos industriales.
Coordenadas	6.15, 7.78 / -76.65, -75.34 (Latitud mínima, máxima / Longitud mínima/máxima)

Descripción

Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). Misión: Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción. El objetivo de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT es conservar en condiciones óptimas las cepas microbianas aisladas del territorio nacional con el fin de acceder a su información molecular y bioquímica con fines científicos no comerciales. Adicionalmente se tiene por objetivo fortalecer el Inventario Nacional de la Biodiversidad y difundir el conocimiento científico acerca de la riqueza de microorganismos y su potencial e importancia en los ecosistemas colombianos. El énfasis de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT está inicialmente enfocado a la conservación de bacterias, hongos y levaduras con el fin de investigar su potencial en diferentes áreas de la industria: agrícola, alimentos y química. Visión: En concordancia con la visión de la Universidad EAFIT, la colección de microorganismos tiene como visión contribuir al progreso de la Nación mediante la conservación y el acceso de la colección. Específicamente se proyecta ampliar la colección de microorganismos para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la biodiversidad nativa colombiana y su potencial en diferentes ámbitos industriales.

Coordenadas

6.15, 7.78 / -76.65, -75.34 (Latitud mínima, máxima / Longitud mínima/máxima)

Cobertura Taxonómica

Descripción	Microorganismos (Bacterias y Levaduras). Filo Proteobacteria (familias: Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Xanthomonadaceae). Filo Actinobacteria (familias Microbacteriaceae, Mycobacteriaceae). Filo Firmicutes (familia: Bacillaceae) Filo Bacteriodetes (familia: Flavobacteriaceae)

Cobertura Temporal

Fecha inicial / Fecha final	2017-12-26 / 2016-06-23

Métodos de Muestreo

Descripción del muestreo	Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia. Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido. Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE. Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO47H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO47H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0). Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica

Descripción del muestreo

Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia. Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido. Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE. Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO4*7H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO4*7H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0). Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica

Datos de la Colección

Nombre de la colección	Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp.
Identificador de la colección	EA-ED
Identificador de la colección parental	RNC 226

Datos del Proyecto

Título	Se colectaron en dos proyectos: 1)Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.
(Personal) Nombre	Valeska Villegas-Escobar
Fuentes de financiación	EAFIT-AUGURA y Colciencias
Descripción del área de estudio	La investigación se desarrolló en la Universidad EAFIT - Medellín - Colombia

Palabras Clave

Microorganismos; bacterias; levaduras; Specimen

Parte Asociada 1

Nombre	Jaiver Danilo Sanchez
Posición	Director
Organización	Cenibanano

GBIF Integrated Publishing Toolkit(IPT)

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Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp.